>>80875
Сомневаюсь что-то. Потому что бактерий считают под микроскопом вручную.

Хотя в принципе можно применить обработку изображения, дающую удовлетворительную точность счёта: определить порог, размыть смарт-блёром, ужесточить границы, довести контраст до чёрного-белого и посчитать образовавшиеся зёрна.
Но я сразу же вижу вариант для неверного счёта. Прикрепил.
Коррекция подобного требует дополнительного обсчёта примерных размеров и программа будет путаться в зависимости от порога. Человек определяет границы по относительному контрасту. Задать программе такие нечёткие условия возможно, но задачка не самая простая.

Всю обработку наверняка можно сделать через макрос фотошопа. А вот подсчёт под вопросом. Скорее всего придётся написать.

В фотошопе только контрастность добавляю. И смарт блюр, и резкость, и пороги дают потерю информации, как ты и говоришь. Но если так подумать, потеря информации будет примерно одинаковой и на картинках "до", и "после", а значит стабильные "-10%" не изменит общей картины, возможно.
В любом случае без считалки все упирается в массу ручной работы. А значит рано или поздно придется писать. А я в этом вообще ноль, на сколько реально навернуть учебников и в одно рыло написать такую программу? И в каком языке брать учебники?

>>80902
Если есть деньги легче обратится к программисту.

>>80902
Бери си-подобный язык (достаточная гибкость и возможность найти готовые алгоритмы), проверяй как там дело обстоит со считыванием-записью пикселей.
Но без опыта прийдётся навернуть матана, чтобы понять как описать машине то, что ты ищешь, преобразовать картинку в матрицы/графы/вектор, посчитать предполагаемую замылившуюся границу пятна, исходя из усреднённой формы и размера. А до этого описать на бумаге в словах, что такое «пятно» и как ты его отличаешь от всего прочего.

> Существует ли софт, который умеет такое?

Что-то типа

> Video Image Segmentation and Object Detection

http://ethesis.nitrkl.ac.in/146/1/badri-mtech.pdf
Готовый софт, чтоб запустить и нажать найдешь вряд ли, имхо. Прпидется же пороги выбирать и прочее.

К своему удивлению, читая рандомные научпоп статьи случайно наткнулся на готовый софт, специально для такого вот. http://www.cellprofiler.org/
Может и считать клетки, и отмечать на исходном изображении посчитанные клетки, и еще просто уйму всего интересного. Например видел видеоурок, о обучении программы узнавать нужные клетки, вручную показывая где они, а где не они https://youtu.be/XMKgiRGb4IY?list=PL7CC87670239B4D10